Hoi, leuk dat je geinteresseerd bent in het D2OL-project! ![]()
Ik heb geprobeerd zo efficient mogelijk te antwoorden op de meest gestelde
vragen en vragen die je als beginner zou kunnen hebben. Mocht je nou ergens
toch niet uitkomen, neem dan zo snel mogelijk contact met me op! Ik zal dan
m'n best doen om je een passend antwoord te geven.
Veel graasplezier bij D2OL!!!
Silk_dude
erikvanas@hotmail.com
44708158
Als je wat verder gevorderd bent heb je misschien andere vragen, zie hiervoor
pagina 2
van deze FAQ!
Dit distributed computing project gebruikt computers van thuisgebruikers
(zoals jij) om medicijnen te zoeken voor de ziektes Ebola, Miltvuur (Anthrax),
Pokken (Smallpox), SARS en Malaria, de 5 meest besmettelijke ziektes op aarde.
D2OL doet dit volgens het sleutelgat/sleutel principe, het "past"
moleculen van mogelijke medicijnen in moleculen van de ziektes. De beste kandidaat-medicijnen
(volgens de computerberekeningen) worden dan in het laboratorium van TRI (The
Rothberg Institute) getest door wetenschappers. Dit instituut is een non-profit
instituut, dus je hoeft niet bang te zijn dat ze bakken met geld willen verdienen
met jouw computerkracht.
Het programma waarmee D2OL deze berekeningen doet (de client) wordt gemaakt
door Sengent. Dit is hetzelfde bedrijf dat de TSC client maakt, en verder
hebben ze nog enkele andere (kleinere) distributed computing-clients op hun
naam staan. Overigens zijn TSC en D2OL volbloed zusjes, ze worden allebei
door TRI geleid en hebben dezelfde infrastructuur.
Ik geef een uitleg voor de windows client. Als je linux gebruikt acht ik
je zelf slim genoeg om de client te installeren en ervoor te zorgen dat 'ie
altijd opstart. Registreren op de site is hetzelfde bij beide besturingssystemen.
Als eerste: download de client hier.
Installeer 'm vervolgens volgens de on-screen instructies. Als hij vraagt
of je 'm wil starten als je windows opstart zeg je "ja" en klik je op "Done".
Dan start de client automatisch op en vraagt hij om je e-mail adres. Vul deze
in, want die heb je nodig bij het registreren op de website.
Vervolgens registreer je je op de registratiepagina.
De instructies wijzen je de goeie weg (hint: een node is een ander woord voor
client).
Na het registreren moet je even inloggen
op je homepage. Kijk nu helemaal onderaan en klik op "Add node". Nu zie je
je NodeID staan met ervoor [add]. (als dat niet zo is, wacht dan een kwartiertje/half
uur). Klik daarop.
Terwijl je nog ingelogd bent surf je naar de teampage van DPC.
Klik hier op "Join" en je bent helemaal ready & set to go!
De client is redelijk aan de zware kant. Volgens de site van D2OL zelf gelden
de volgende richtlijnen:
Op Windows Server 2003 draait de client ook goed. Ik zou de client zeker
niet installeren op een pc met minder dan 192 Mb geheugen, je merkt dan namelijk
duidelijk dat de client aanwezig is.
TIP: zet in de client bij "Properties" (knopje
met een V links in het midden) de optie "Launch main window on startup"
uit, en zet de optie "Enable animations" ook uit. Het grafische
deel van de client is namelijk erg zwaar, terwijl je er feitelijk niets aan
hebt. Gelukkig zijn het rekendeel en het grafische deel goed gescheiden, zodat
je daar geen last van hebt.
Er zijn clients voor Windows, Mac OS X, Solaris en Linux. Als je clients voor
1 van de laatste 3 wil gebruiken en je komt er niet uit, vraag dan hulp op
het forum op de D2OL website. Daar zitten bijna altijd mensen die je kunnen
helpen.
Met behulp van het free-ware tooltje FireDaemon
(versie Lite 1.6 GA) kan dat heel eenvoudig. Installeer eerst de D2OL client
zoals je normaal zou doen (zet "Launch main window on startup" uit en de optie
"Enable animations" ook). Vervolgens installeer je FireDaemon, naar eigen
smaak.
Er is een hele goeie externe tool genaamd Dspy.
Download het programma, zet 'm in de d2ol directory en maak een snelkoppeling
aan in de "opstarten" map in je Startmenu. Start het programma nu, je ziet
dan het scherm dat hieronder staat.
Klik op "bladeren" en zoek de directory op waar je de client hebt geïnstalleerd
(C:\Program Files\SengentD2OL\ ).
Je ziet nu als het goed iets dat er "Bezig..." komt te staan. Elke
candidate bestaat uit 20 conformers die hij moet doorrekenen. Hier kun je
dus zien hoe ver hij met een candidate is, en na 20 conformers begint 'ie
aan een nieuwe candidate. De oranje gekleurde conformer is de slechtste, de
blauwe is de beste (lagere energiewaarde is dus beter).
Als je nu dubbelklikt in dspy zie je een staafdiagram met je output van de
laatste dagen:

De puntentelling wordt bijgehouden door middel van het aantal candidates.
Elke dag vind je op ons forum
de hitparade van de vorige dag (zoek naar een topic "[D2OL] Hitparade van
22 januari" bijvoorbeeld). Als je wil zien wat je vandaag allemaal al gedaan
hebt: R4NCOR heeft een
geweldige stats-site voor DPC gemaakt. Verder kan je op www.d2ol.com
zelf zien wat er allemaal gebeurt onder "statistics".
Daarnaast heb ik een simpele
statspage en hebben TA_Geoffs
(Team Anandtech) en Shauge
(Team Norge/Norway) ieder een hele complete statssite gemaakt.
Yep, dat kan, op 2 manieren. De eerste is dat je je inbuffer op 2000 zet
(via de "Properties" knop in de client) en wacht tot hij vol is gelopen. Vervolgens
zet je de client op "offline" door op de knop te drukken met de groene stip.
Na 2000 candidates zet je 'm weer op online en heb je een MF van 2000 candidates.
Verder is er nog de "addflush". Je installeert dan een client en laat 'm
grazen, zonder 'm toe te voegen bij "Add nodes". De resultaten worden dan
niet opgeteld bij je totaal tot je de node toevoegt. Zo kan je in 1 keer meer
dan 2000 candidates toevoegen.
